Le Programme de laboratoire de l'Inspectorat fournit des services d'analyse chimique, physique et microbiologique à l'appui des activités d'inspection, d'enquête et de surveillance de l'Inspectorat. Les laboratoires du Programme de laboratoire logent dans deux installations situées dans les villes de Toronto (Ontario) et de Longueuil (Québec). Ils fournissent des services d'analyse aux inspecteurs des cinq centres opérationnels de l'Inspectorat du pays (à Darmouth, Longueuil, Toronto, Winnipeg et Burnaby) ainsi qu'à l'Inspectorat Ottawa (IO) situé à Ottawa. Le Programme de laboratoire fournit également du support à d'autres Directions de la Direction générale des produits de santé et des aliments (DGPSA), dont le Bureau de la surveillance des médicaments et le Bureau de l'évaluation des produits pharmaceutiques, des données d'analyse pour appuyer leurs activités d'évaluation pré- et post-approbation.